El Servicio de Administración del IMFE constituye un área de trabajo estructural que da soporte a la actividad del organismo y facilita el cumplimiento de sus fines. La gestión económica y presupuestaria, del patrimonio y de los recursos humanos son sus principales pilares. Son las siguientes sus funciones:

• Prestar apoyo técnico y administrativo a los Órganos de Gobierno, Dirección, Secretaría y Servicios generales del IMFE.
• Abrir, impulsar y custodiar los expedientes administrativos.
• Llevar el Registro General del IMFE.
• Mantener y mejorar las infraestructuras.
• Ejecutar el presupuesto.
• Contratar administrativamente y gestionar el patrimonio.
• Gestionar los recursos humanos.
• Controlar y dinamizar la gestión administrativa.
• Asistir y asesorar técnica y jurídicamente.
• Racionalizar la gestión económica.